El actual museo está situado en un edificio sobre la necrópolis tardorromana de San Antón. El yacimiento ocupa la nave central.
La visita sigue un estricto orden cronológico, desde el Paleolítico y la Edad del Bronce, pasando por la época romana, hasta piezas de arquitectura y artes menores del siglo pasado. La propia necrópolis de San Antón constituye, perfectamente integrada en el conjunto arquitectónico, uno de los principales puntos de interés.